特定の明細を収支計算から除外することができますか？

はい、可能です。 
明細の編集画面にある「収支に含めない」という設定にチェックすることで、その明細を「支出」や「収入」の集計対象から外し、計算に含まないようにすることができます。

「収支に含めない」の設定方法はこちら